Рассмотрены возможности налогового стимулирования инновационной активности хозяйствующих субъектов в АПК России. На примере ЗАО «Лебяжье-Чепигинское» Брюховецкого района Краснодарского края показано, что инвестиционные льготы нередко становятся дополнительными расходами сельхозорганизаций. Раскрываются резервы использования налоговых льгот, амортизационных премий, инвестиционного налогового кредита и других инструментов.